Project information
Possibilities for studying circadian rhythms in ancient populations (Cirkadiánní rytmy aDNA)

Cirkadiánní rytmy řídí základní fyziologické procesy člověka, jako je spánek, aktivita a metabolismus, přičemž jejich individuální variabilita je geneticky podmíněná a polygenní. V posledních letech se ukazuje, že část této variability může souviset s genetickými variantami pocházejícími od historických lidských populací, jejichž studium je možné prostřednictvím analýzy starobylé DNA (aDNA). Díky rozvoji sekvenování nové generace (NGS) je dnes možné získávat genomová data i z výrazně degradovaných vzorků a studovat komplexní genetickou architekturu nemendelovsky děděných znaků. Cílem bude rozšíření diplomové práce o sekvenování vybraných cirkadiánních genomových oblastí metodami sekvenování nové generace (NGS). Získaná data budou následně zpracována bioinformatickými metodami a vyhodnocena pomocí polygenního rizikového skóre (polygenic risk score, PRS) u starobylých populací. Tento přístup umožní propojit evoluční perspektivu s moderními genetickými metodami.