prof. Mgr. Jiří Damborský, Dr.

2019

• Caver web: identification of tunnels and channels in proteins and analysis of ligand transport

  ŠTOURAČ Jan VAVRA O. KOKKONEN Piia Pauliina FILIPOVIČ Jiří FONSECA PINTO Gabriela Filipa SCHENKMAYEROVÁ Andrea DAMBORSKÝ Jiří BEDNÁŘ David

  Konferenční abstrakty

  Rok: 2019, druh: Konferenční abstrakty

• CaverDock: a molecular docking-based tool to analyse ligand transport through protein tunnels and channels

  VÁVRA Ondřej FILIPOVIČ Jiří PLHÁK Jan BEDNÁŘ David MARQUES Sérgio Manuel BREZOVSKÝ Jan ŠTOURAČ Jan MATYSKA Luděk DAMBORSKÝ Jiří

  Článek v odborném periodiku

  Bioinformatics, rok: 2019, ročník: 35, vydání: 23, DOI

• Collagen-based dermal substitute with stable fibroblast growth factor 2 (FGF2): ex ovo and in vivo impact on neovascularization

  LIPOVÝ Břetislav VOJTOVÁ Lucy HOLOUBEK Jakub ZÍDEK Jana KNOZ Martin BABRNAKOVA Johana PAVLIŇÁKOVÁ Veronika VIŠTĚJNOVÁ Lucie ŠTĚPÁNKOVÁ Veronika FILOVÁ Eva PAVLOVSKÝ Zdeněk FALDYNA Martin GÖPFERT Eduard DAMBORSKÝ Jiří HEARNDEN Vanessa

  Konferenční abstrakty

  Rok: 2019, druh: Konferenční abstrakty

• Computational Design of Stable and Soluble Biocatalysts

  MUSIL Miloš KONEGGER Hannes HON Jiří BEDNÁŘ David DAMBORSKÝ Jiří

  Článek v odborném periodiku

  ACS Catalysis, rok: 2019, ročník: 9, vydání: 2, DOI

• Computational Modelling of Metabolic Burden and Substrate Toxicity in Escherichia coli Carrying a Synthetic Metabolic Pathway

  DEMKO Martin CHRÁST Lukáš DVOŘÁK Pavel DAMBORSKÝ Jiří ŠAFRÁNEK David

  Článek v odborném periodiku

  Microorganisms, rok: 2019, ročník: 7, vydání: 11, DOI

• Computational Study of Protein-Ligand Unbinding for Enzyme Engineering

  MARQUES Sérgio Manuel BEDNÁŘ David DAMBORSKÝ Jiří

  Článek v odborném periodiku

  FRONTIERS IN CHEMISTRY, rok: 2019, ročník: 6, vydání: JAN 2019, DOI

• Controlled Oil/Water Partitioning of Hydrophobic Substrates Extending the Bioanalytical Applications of Droplet-Based Microfluidics

  BURYŠKA Tomáš VAŠINA Michal GIELEN Fabrice VAŇÁČEK Pavel VAN VLIET Liisa JEZEK Jan PILAT Zdenek ZEMÁNEK Pavel DAMBORSKÝ Jiří HOLLFELDER Florian PROKOP Zbyněk

  Článek v odborném periodiku

  Analytical Chemistry, rok: 2019, ročník: 91, vydání: 15, DOI

• Crystal structure of the cold-adapted haloalkane dehalogenase DpcA from Psychrobacter cryohalolentis K5

  TRATSIAK K. PRUDNIKOVA Tanyana DRIENOVSKÁ Ivana DAMBORSKÝ Jiří BRYNDA Jiří PACHL Petr KUTÝ Michal CHALOUPKOVÁ Radka REZACOVA P. SMATANOVA I.K.

  Článek v odborném periodiku

  ACTA CRYSTALLOGRAPHICA SECTION F-STRUCTURAL BIOLOGY COMMUNICATIONS, rok: 2019, ročník: 75, vydání: MAY 2019, DOI

• Crystallization and Crystallographic Analysis of a Bradyrhizobium Elkanii USDA94 Haloalkane Dehalogenase Variant with an Eliminated Halide-Binding Site

  PRUDNIKOVA T. KASCAKOVA B. MESTERS J.R. GRINKEVICH P. HAVLICKOVA P. MAZUR A. SHAPOSHNIKOVA A. CHALOUPKOVÁ Radka DAMBORSKÝ Jiří KUTY M. SMATANOVA I.K.

  Článek v odborném periodiku

  CRYSTALS, rok: 2019, ročník: 9, vydání: 7, DOI

• Deciphering the Structural Basis of High Thermostability of Dehalogenase from Psychrophilic Bacterium Marinobacter sp. ELB17

  CHRÁST Lukáš TRATSIAK K. PLANAS IGLESIAS Joan DANIEL Lukáš PRUDNIKOVA T. BREZOVSKÝ Jan BEDNÁŘ David SMATANOVA I.K. CHALOUPKOVÁ Radka DAMBORSKÝ Jiří

  Článek v odborném periodiku

  Microorganisms, rok: 2019, ročník: 7, vydání: 11, DOI