Stanislav Mazurenko, PhD

2024

• PredictONCO: a web tool supporting decision-making in precision oncology by extending the bioinformatics predictions with advanced computing and machine learning

  ŠTOURAČ Jan BORKO Simeon KHAN Rayyan Tariq POKORNÁ Petra DOBIÁŠ Adam PLANAS IGLESIAS Joan MAZURENKO Stanislav RANGEL PAMPLONA PIZARRO PINTO José Gaspar SZOTKOWSKÁ Veronika ŠTĚRBA Jaroslav SLABÝ Ondřej DAMBORSKÝ Jiří BEDNÁŘ David

  Článek v odborném periodiku

  Briefings in Bioinformatics, rok: 2024, ročník: 25, vydání: 1, DOI

• Protein representations: Encoding biological information for machine learning in biocatalysis

  HARDING-LARSEN David FUNK Jonathan MADSEN Niklas Gesmar GHARABLI Hani ACEVEDO-ROCHA Carlos G. MAZURENKO Stanislav WELNER Ditte Hededam

  Článek v odborném periodiku

  Biotechnology Advances, rok: 2024, ročník: 77, vydání: December 2024, DOI

• Revealing data leakage in protein interaction benchmarks

  BUSHUIEV Anton BUSHUIEV Roman SEDLAR Jiri PLUSKAL Tomas DAMBORSKÝ Jiří MAZURENKO Stanislav SIVIC Josef

  Článek ve sborníku

  ICLR 2024 Workshop on Generative and Experimental Perspectives for Biomolecular Design, rok: 2024

• Special Issue on Artificial Intelligence for Synthetic Biology

  MARTIN Hector Garcia MAZURENKO Stanislav ZHAO Huimin

  Článek v odborném periodiku (nerecenzovaný)

  Rok: 2024, druh: Článek v odborném periodiku (nerecenzovaný)

• Successor Sequence Predictor (SSP)

  KHAN Rayyan Tariq KOHOUT Pavel MUSIL Miloš ROSÍNSKÁ Monika DAMBORSKÝ Jiří MAZURENKO Stanislav BEDNÁŘ David VILÍM Jan

  Software

  Rok: 2024

2023

• In-depth analysis of biocatalysts by microfluidics: An emerging source of data for machine learning

  VAŠINA Michal KOVÁŘ David DAMBORSKÝ Jiří YUN Ding YANG Tianjin DE MELLO Andrew MAZURENKO Stanislav STAVRAKIS Stavros PROKOP Zbyněk

  Článek v odborném periodiku

  Biotechnology Advances, rok: 2023, ročník: 66, vydání: September 2023, DOI

• Machine Learning-Guided Protein Engineering

  KOUBA Petr KOHOUT Pavel HADDADI Faraneh BUSHUIEV Anton SAMUSEVICH Raman SEDLAR Jiri DAMBORSKÝ Jiří PLUSKAL Tomáš SIVIC Josef MAZURENKO Stanislav

  Článek v odborném periodiku

  ACS Catalysis, rok: 2023, ročník: 13, vydání: 21, DOI

2022

• Advanced database mining of efficient haloalkane dehalogenases by sequence and structure bioinformatics and microfluidics

  VAŠINA Michal VAŇÁČEK Pavel HON Jiri KOVÁŘ David FALDYNOVÁ Hana KUNKA Antonín BURYŠKA Tomáš BADENHORST Christoffel P. S. MAZURENKO Stanislav BEDNÁŘ David STAVRAKIS Stavros BORNSCHEUER Uwe T. DEMELLO Andrew DAMBORSKÝ Jiří PROKOP Zbyněk

  Článek v odborném periodiku

  Chem Catalysis, rok: 2022, ročník: 2, vydání: 10, DOI

• CalFitter 2.0: Leveraging the power of singular value decomposition to analyse protein thermostability

  KUNKA Antonín LACKO David ŠTOURAČ Jan DAMBORSKÝ Jiří PROKOP Zbyněk MAZURENKO Stanislav

  Článek v odborném periodiku

  Nucleic acids research, rok: 2022, ročník: 50, vydání: W1, DOI

• MAPityser 2.1 - Analyzátor dat pro mikrofluidní platformu MAPit

  KOVÁŘ David MAZURENKO Stanislav DAMBORSKÝ Jiří PROKOP Zbyněk

  Software

  Rok: 2022