Mgr. Michal Vašina, Ph.D.

2025

• Automated Engineering Protein Dynamics via Loop Grafting: Improving Renilla Luciferase Catalysis

  PLANAS IGLESIAS Joan MAJEROVÁ Marika PLUSKAL Daniel VAŠINA Michal DAMBORSKÝ Jiří PROKOP Zbyněk MAREK Martin BEDNÁŘ David

  Článek v odborném periodiku

  ACS Catalysis, rok: 2025, ročník: 15, vydání: 4, DOI

• Engineering Dehalogenase Enzymes Using Variational Autoencoder-Generated Latent Spaces and Microfluidics

  KOHOUT Pavel VAŠINA Michal MAJEROVÁ Marika NOVÁKOVÁ Veronika DAMBORSKÝ Jiří BEDNÁŘ David MAREK Martin PROKOP Zbyněk MAZURENKO Stanislav

  Článek v odborném periodiku

  JACS Au, rok: 2025, ročník: 5, vydání: 2, DOI

• Functional Characterization of Luciferase in a Brittle Star Indicates Parallel Evolution Influenced by Genomic Availability of Haloalkane Dehalogenase

  LAU Emily S. MAJEROVÁ Marika HENSLEY Nicholai M. MUKHERJEE Arnab VAŠINA Michal PLUSKAL Daniel DAMBORSKÝ Jiří PROKOP Zbyněk DELROISSE Jerome BAYAERT Wendy-Shirley PAREY Elise OLIVERI Paola MARLETAZ Ferdinand MAREK Martin OAKLEY Todd H.

  Článek v odborném periodiku

  Molecular Biology and Evolution, rok: 2025, ročník: 42, vydání: 5, DOI

• Quantum computing for faster enzyme discovery and engineering

  DAMBORSKÝ Jiří KOUBA Petr SIVIC Josef VAŠINA Michal BEDNÁŘ David MAZURENKO Stanislav

  Článek v odborném periodiku

  Nature Catalysis, rok: 2025, ročník: 8, vydání: 9, DOI

2024

• Nová duální dehalogenáza-luciferáza z hvězdice křehké Amphiura filiformis

  MAJEROVÁ Marika VAŠINA Michal PLUSKAL Daniel SEDLÁČKOVÁ Karolina PROKOP Zbyněk DAMBORSKÝ Jiří MAREK Martin

  Technicky realizované výsledky (prototyp, funkční vzorek)

  Rok: 2024

• Nová vysoce aktivní luciferáza z hvězdice křehké Amphiura filiformis

  MAJEROVÁ Marika VAŠINA Michal PLUSKAL Daniel SEDLÁČKOVÁ Karolina PROKOP Zbyněk DAMBORSKÝ Jiří MAREK Martin

  Technicky realizované výsledky (prototyp, funkční vzorek)

  Rok: 2024

2023

• Advancing Enzyme's Stability and Catalytic Efficiency through Synergy of Force-Field Calculations, Evolutionary Analysis, and Machine Learning

  KUNKA Antonín MARQUES Sérgio Manuel HAVLÁSEK Martin VAŠINA Michal VELÁTOVÁ Nikola CENGELOVÁ Lucia KOVÁŘ David DAMBORSKÝ Jiří MAREK Martin BEDNÁŘ David PROKOP Zbyněk

  Článek v odborném periodiku

  ACS Catalysis, rok: 2023, ročník: 13, vydání: 19, DOI

• In-depth analysis of biocatalysts by microfluidics: An emerging source of data for machine learning

  VAŠINA Michal KOVÁŘ David DAMBORSKÝ Jiří YUN Ding YANG Tianjin DE MELLO Andrew MAZURENKO Stanislav STAVRAKIS Stavros PROKOP Zbyněk

  Článek v odborném periodiku

  Biotechnology Advances, rok: 2023, ročník: 66, vydání: September 2023, DOI

2022

• Advanced database mining of efficient haloalkane dehalogenases by sequence and structure bioinformatics and microfluidics

  VAŠINA Michal VAŇÁČEK Pavel HON Jiri KOVÁŘ David FALDYNOVÁ Hana KUNKA Antonín BURYŠKA Tomáš BADENHORST Christoffel P. S. MAZURENKO Stanislav BEDNÁŘ David STAVRAKIS Stavros BORNSCHEUER Uwe T. DEMELLO Andrew DAMBORSKÝ Jiří PROKOP Zbyněk

  Článek v odborném periodiku

  Chem Catalysis, rok: 2022, ročník: 2, vydání: 10, DOI

• MicroPEX Data Analyser 1.0*

  KOVÁŘ David MAZURENKO Stanislav VAŠINA Michal DAMBORSKÝ Jiří PROKOP Zbyněk

  Software

  Rok: 2022