Mgr. Jan Brezovský, Ph.D.

2016

• Discovery of Novel Haloalkane Dehalogenase Inhibitors

  BURYŠKA Tomáš DANIEL Lukáš KUNKA Antonín BREZOVSKÝ Jan DAMBORSKÝ Jiří PROKOP Zbyněk

  Článek v odborném periodiku

  Applied and Environmental Microbiology, rok: 2016, ročník: 82, vydání: 6, DOI

• Engineering a de Novo Transport Tunnel

  BREZOVSKÝ Jan BABKOVÁ Petra DEGTJARIK Oksana FOŘTOVÁ Andrea GÓRA Artur Wiktor IERMAK L. ŘEZÁČOVÁ Petra DVOŘÁK Pavel KUTÁ-SMATANOVÁ Ivana PROKOP Zbyněk CHALOUPKOVÁ Radka DAMBORSKÝ Jiří

  Článek v odborném periodiku

  ACS Catalysis, rok: 2016, ročník: 6, vydání: 11, DOI

• HotSpot Wizard 2.0: Automated Design of Site-Specific Mutations and Smart Libraries in Protein Engineering

  BENDL J. ŠTOURAČ Jan ŠEBESTOVÁ Eva VÁVRA Ondřej MUSIL Miloš BREZOVSKÝ Jan DAMBORSKÝ Jiří

  Článek v odborném periodiku

  Nucleic Acids Research, rok: 2016, ročník: 44, vydání: W1, DOI

• PredictSNP2: A Unified Platform for Accurately Evaluating SNP Effects by Exploiting the Different Characteristics of Variants in Distinct Genomic Regions

  BENDL Jaroslav MUSIL Miloš ŠTOURAČ Jan ZENDULKA Jaroslav DAMBORSKÝ Jiří BREZOVSKÝ Jan

  Článek v odborném periodiku

  PLOS COMPUTATIONAL BIOLOGY 12: e100496, rok: 2016, ročník: 12, vydání: 5, DOI

• Role of Tunnels and Gates in Enzymatic Catalysis

  MARQUES Sérgio Manuel BREZOVSKÝ Jan DAMBORSKÝ Jiří

  Kapitola v knize

  UNDERSTANDING ENZYMES: FUNCTION, DESIGN, ENGINEERING, AND ANALYSIS, rok: 2016, počet stran: 43 s.

• Tools and data services registry: a community effort to document bioinformatics resources

  ISON Jon RAPACKI Kristoffer MENAGER Herve KALAS Matus RYDZA Emil CHMURA Piotr ANTHON Christian BEARD Niall BERKA Karel BOLSER Dan BOOTH Tim BRETAUDEAU Anthony BREZOVSKÝ Jan CASADIO Rita CESARENI Gianni COPPENS Frederik CORNELL Michael CUCCURU Gianmauro DAVIDSEN Kristian DELLA VEDOVA Gianluca DOGAN Tunca DOPPELT-AZEROUAL Olivia EMERY Laura GASTEIGER Elisabeth GATTER Thomas GOLDBERG Tatyana GROSJEAN Marie GRUNING Bjoern HELMER-CITTERICH Manuela IENASESCU Hans IOANNIDIS Vassilios JESPERSEN Martin Closter JIMENEZ Rafael JUTY Nick JUVAN Peter KOCH Maximilian LAIBE Camille LI Jing-Woei LICATA Luana MAREUIL Fabien MICETIC Ivan FRIBORG Rune Mollegaard MORETTI Sebastien MORRIS Chris MOLLER Steffen NENADIC Aleksandra PETERSON Hedi PROFITI Giuseppe RICE Peter ROMANO Paolo RONCAGLIA Paola SAIDI Rabie SCHAFFERHANS Andrea SCHWAMMLE Veit SMITH Callum SPEROTTO Maria Maddalena STOCKINGER Heinz SVOBODOVÁ VAŘEKOVÁ Radka TOSATTO Silvio C. E. DE LA TORRE Victor UVA Paolo VIA Allegra YACHDAV Guy ZAMBELLI Federico VRIEND Gert ROST Burkhard PARKINSON Helen LONGREEN Peter BRUNAK Soren

  Článek v odborném periodiku

  Nucleic Acids Research, rok: 2016, ročník: 44, vydání: D1, DOI

2015

• Balancing the Stability-Activity Trade-off by Fine-Tuning Dehalogenase Access Tunnels.

  LIŠKOVÁ Veronika BEDNÁŘ David PRUDNIKOVA T. REZACOVA P. KOUDELÁKOVÁ Táňa ŠEBESTOVÁ Eva KUTA- SMATANOVÁ I., BREZOVSKÝ Jan CHALOUPKOVÁ Radka DAMBORSKÝ Jiří

  Článek v odborném periodiku

  ChemCatChem, rok: 2015, ročník: 7, vydání: 4, DOI

• CaverWeb 0,2

  ŠTOURAČ Jan BREZOVSKÝ Jan DAMBORSKÝ Jiří

  Software

  Rok: 2015

• FireProt: Energy- and Evolution-Based Computational Design of Thermostable Multiple-Point Mutants

  BEDNÁŘ David BEERENS Koen ŠEBESTOVÁ Eva BENDL Jaroslav KHARE S. CHALOUPKOVÁ Radka PROKOP Zbyněk BREZOVSKÝ Jan BAKER D. DAMBORSKÝ Jiří

  Článek v odborném periodiku

  PLOS COMPUTATIONAL BIOLOGY, rok: 2015, ročník: 11, vydání: 11, DOI

• HotSpot Wizard 2.0

  ŠTOURAČ Jan BENDL Jaroslav ŠEBESTOVÁ Eva VÁVRA Ondřej MUSIL Miloš BREZOVSKÝ Jan DAMBORSKÝ Jiří

  Software

  Rok: 2015