doc. Mgr. David Bednář, Ph.D.

2024

• Stabilní lidský fibroblastový růstový faktor 8 (FGF8-STAB)

  VILÍM Jan GHAZALOVÁ Tereza HORÁKOVÁ Denisa KUTÁLKOVÁ Kateřina BEDNÁŘ David

  Outcomes put into operation (prototype, working sample)

  Year: 2024

• Stabilní lidský fibroblastový růstový faktor 9 (FGF9-STAB)

  VILÍM Jan GHAZALOVÁ Tereza IKRÉNYIOVÁ Tereza KUTALKOVÁ Kateřina BEDNÁŘ David

  Outcomes put into operation (prototype, working sample)

  Year: 2024

• Successor Sequence Predictor (SSP)

  KHAN Rayyan Tariq KOHOUT Pavel MUSIL Miloš ROSÍNSKÁ Monika DAMBORSKÝ Jiří MAZURENKO Stanislav BEDNÁŘ David VILÍM Jan

  Software

  Year: 2024

• Upravená dehalogenáza LinB116 se zlepšenou termostabilitou

  HAVLÁSEK Martin DAMBORSKÝ Jiří BEDNÁŘ David

  Outcomes put into operation (prototype, working sample)

  Year: 2024

• Variační nástroj založený na autoenkodéru pro návrh ancestrálních proteinů

  KOHOUT Pavel DAMBORSKÝ Jiří BEDNÁŘ David

  Software

  Year: 2024

2023

• Advancing Enzyme's Stability and Catalytic Efficiency through Synergy of Force-Field Calculations, Evolutionary Analysis, and Machine Learning

  KUNKA Antonín MARQUES Sérgio Manuel HAVLÁSEK Martin VAŠINA Michal VELÁTOVÁ Nikola CENGELOVÁ Lucia KOVÁŘ David DAMBORSKÝ Jiří MAREK Martin BEDNÁŘ David PROKOP Zbyněk

  Article in Periodical

  ACS Catalysis, year: 2023, volume: 13, edition: 19, DOI

• Atypical homodimerization revealed by the structure of the (S)-enantioselective haloalkane dehalogenase DmmarA from Mycobacterium marinum

  ŠNAJDAROVÁ Karolína MARQUES Sérgio Manuel DAMBORSKÝ Jiří BEDNÁŘ David MAREK Martin

  Article in Periodical

  Acta Crystallographica Section D: Structural Biology, year: 2023, volume: 79, edition: November, DOI

• Catalytic mechanism for Renilla-type luciferases

  SMITH Andrea TOUL Martin PLUSKAL Daniel BAATALLAH Racha GAGNOT Glwadys RANGEL PAMPLONA PIZARRO PINTO José Gaspar SANTANA Vinicius T. T. STUCHLÁ Markéta NEUGEBAUER Petr CHAIYEN Pimchai DAMBORSKÝ Jiří BEDNÁŘ David JANIN Yves L. L. PROKOP Zbyněk MAREK Martin

  Article in Periodical

  Nature Catalysis, year: 2023, volume: 6, edition: 1, DOI

• Comparison of Fungal Thermophilic and Mesophilic Catalase-Peroxidases for Their Antioxidative Properties

  POLJOVKA Andrej MUSIL Miloš BEDNÁŘ David CHOVANOVA Katarina BAUEROVA-HLINKOVA Vladena BELLOVA Jana KOHUTOVA Lenka BARATH Peter ZAMOCKY Marcel

  Article in Periodical

  Antioxidants, year: 2023, volume: 12, edition: 7, DOI

• Computer-assisted stabilization of fibroblast growth factor FGF-18

  VILÍM Jan GHAZALOVÁ Tereza PETULOVÁ Eliška HORACKOVA Aneta STEPANKOVA Veronika CHALOUPKOVÁ Radka BEDNÁŘ David DAMBORSKÝ Jiří PROKOP Zbyněk

  Article in Periodical

  Computational and Structural Biotechnology Journal, year: 2023, volume: 21, edition: October 2023, DOI